במכון הטיהור קיים תהליך ביולוגי המטפל בבוצה. במהלך הטיפול בבוצה נוצר ביוגז שמשמש כדלק למנועי הגז בתחנת הכוח של מכון הטיהור. במכון הטיהור קיימים שני מנועי גז בהספק כולל של 2.5 מגה ואט המייצרים כמחצית תצרוכת האנרגיה של מכון הטיהור. חום מנועי הגז משמש כמקור אנרגיה לחימום הבוצה בריאקטורים הביולוגים. לאחרונה בוצע פרוייקט גדול בהיקף של 5 מיליון ₪ לצורך התקנת גנרטור חירום המופעל באמצעות סולר בהספק כולל של 1800 קוט"ש. הגנרטור החדש שהותקן לאחרונה במכון הטיהור יחד עם שני מנועי ביוגז הקיימים יאפשרו אספקת חשמל רציפה, שאיבת שפכים וטיהורם גם בעת חירום. הפרוייקט החדש יאפשר גמישות בהפעלת מנוע סולר ומנוע גז ויחסוך עלות כספית להפעלת מכון הטיהור. מכון הטיהור בחיפה הינו מכון הטיהור הראשון בארץ שמנצל את גז המתאן ומפיק אנרגיה לתצרוכת פנימית. הפעלת מנועי הביוגז חוסכת כ-7 מליון ₪ לשנה והינה פרוייקט ירוק ומהווה חלק ממחזור מלא של מערך הטיפול בשפכים המפיק קולחים להשבה חקלאית וחשמל מהגז לתצרוכת פנימית.